京都大學的學制為學士4年、碩士2年，博士3年，預科半年到一年。
新學年從每年的4月1日起至次年3月31日止，為兩學期制。上半學期為4月-9月，下半學期為10月-3月。
該校碩士課程除醫(yī)學、海事科學和國際合作學4月和10月都可以入學，博士課程除理學、醫(yī)學、工學、系統(tǒng)信息學、農(nóng)學、海事科學和國際合作學4月和10月都可以入學以外，其余課程都是4月入學。其中，國際合作學4月入學為日語課程，10月入學為全英文課程。碩士、博士的預科課程除經(jīng)營學只能4月入學以外，其他學科4月或10月都可以入學，而醫(yī)學每月都可以入學。
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